El Museu és present a les següents xarxes de treball

• Xarxa de Museus Marítims de la Costa Catalana
• Xarxa de Museus de la Costa Brava
• Xarxa de Museus de societat i territori de les comarques gironines
• Xarxa de Centres de Documentació dels Parcs Naturals de Catalunya
• Coordinadora d'entitats de la pedra seca dels Països Catalans
• Institut Ramón Muntaner

El Museu té projectes de treball amb les següents institucions

• Fundació Ernest Lluch
• Institut Europeu de la Mediterrània
• Linguamon - Casa de les llengues
• Centre de Promoció de la Cultura Popular i Tradicional Catalana
• Vallgrassa. Centres d'Arts Experimentals. Parc Natural del Garraf
• Parc Natural del Montgrí, les Illes Medes i el Baix Ter
• Central de Biblioteques de les comarques de Girona
• SOC de Catalunya

El Museu treballa amb els següents museus i centres d'interpretació

• Museu Darder - Espai d'interpretació de l'Estany
• Castell de Juvinyà - Centre d'interpretació de Sant Joan les Fonts
• El Molí petit - Centre d'interpretació de Sant Joan de les Abadesses
  

Centre de Documentació del Montgrí, illes Medes i Baix Ter

• RECIDA (Red de Centros de Información y Documentación Ambiental)
• L'Estartit Segle XX - Arxiu fotogràfic de Miquel Graells

El Museu té el suport de

• Ajuntament de Torroella de Montgrí
• Consell Comarcal del Baix Empordà
• Diputació de Girona
• Programes Pedagògics i Divulgatius de la Diputació de Girona
• Departament de Cultura i Mitjans de Comunicació de la Generalitat de Catalunya
  • Servei de Museus

Patrocinis i col·laboracions

• La Caixa
• Itisa
• Enplater
• Caixa de Girona
• Caja Madrid
• Llibre de la Festa Major de Torroella de Montgrí
• Departament d'Interior i Relacions Institucionals i Participació de la Generalitat de Catalunya

Enllaços d'interès

• Oficina de Turisme de l'Estartit
• Ermita de Santa Caterina
• Montgrí natura