El Museu de la Mediterrània ofereix al llarg de l’any tres propostes expositives diferents.

Les sales on s'exposa la permanent del Museu de la Mediterrània

I dos espais amb exposicions temporals:

A l’espai Baix Ter, una proposta d’exposicions lligades a la Mediterrània i al Montgrí, les illes Medes i el Baix Ter.

A l’espai Montgrí, el Cicle Ponts, una proposta d’exposicions d’art contemporani amb creadors del nostre país i de la Mediterrània que vol ser un punt de trobada i de diàleg a l’entorn de la cultura mediterrània.

Tot i la seva varietat i diversitat, sempre tenen com a fil comú la seva connexió amb el projecte museístic mediterrani del centre.